主角工(gōng )(🍅)藤新一原本是一位颇具(📒)名声的高中生侦探,在目击黑暗组织的地下交易后,正准备追踪时却被突袭击昏(hūn ),并被灌下代号为“APTX4869”的不明药aaa。后来虽(suī )然幸免(🛹)于死,但身体(tǐ )就此缩小为小学时期的模样。之后他化名为江户川柯(⏺)南,在邻居(🚣)阿笠博士(📯)的建议(⏯)下,寄住在女友毛利兰的(de )父亲(qīn )—侦探毛利小五郎家中(🤸),继续秘密从事追查黑暗组织的工(gōng )作,并(bìng )(🔔)私下探寻获得解药的管道,希望能(🧟)够恢复原来新一的样貌。与此同时,柯南凭着自己(🐾)的推理天份,配合阿笠博士为他发(💅)明的道具,帮助毛(máo )利小五郎成为出名的大侦探。故事内容当中穿插许多爱情、友情(qíng )、犯罪、背(bèi )叛、复仇等情节。