主角工藤新一原本是一位颇具名声的高中生侦探,在目击黑暗组织的地下交易后,正准备追踪时却被突袭击昏,并被灌(guàn )下代号为“APTX4869”的不明(🗄)药aaa。后来虽然(🔲)幸免(miǎn )于死,但(🐖)身体就此缩小为小学时期的模样。之后他化名为江户川柯南(nán ),在(📎)邻(lín )居阿笠博士的建议下(😞),寄(jì )住在女友毛利兰的父亲—侦探毛利小(🐑)五郎家中,继续秘密(mì )从事追查黑暗组织的工作,并私下探寻获(huò )得(dé )解(👺)药的管道,希(🕐)望能够恢(huī )复原(⚾)来新一(👣)的样貌。与此同时(shí ),柯南凭着自己的推理天份,配合阿笠博士为他发明(míng )的道具,帮(💯)助毛利小五郎成为出名的大侦探(tàn )(⏲)。故事内容当中穿插许多爱情、友情(qíng )、犯罪、背叛、复仇等情节。