主角工(gōng )藤新一原(yuán )本是一位颇具名声的高中生侦探,在目击黑暗组织的地下交易后,正准备追踪时却被突袭击昏,并被(bèi )灌下代号为“APTX4869”的不明药aaa。后来虽然(🔲)幸(🥄)免于死,但身(🕌)体就此缩小为小(xiǎo )学时期的(de )模样。之后他化名(😱)为江(🤷)户川(chuān )柯南,在邻居阿笠博士的建议下,寄住在女友(🌑)毛利兰的(de )父亲—侦(🙂)探(tàn )毛利小五郎家中,继续秘密从事追查黑暗组织的工作(zuò ),并私下探寻获得解药的管道,希望能够恢(huī )复原来新一(👣)的样貌。与此同时,柯(kē )南凭着(💍)自己的推理天份,配合阿笠博士为他发明(🌼)的道具,帮助毛利小五郎成为出名(míng )的大侦探。故事内容当中穿插许多爱情、友情(🏴)、犯罪、背叛(🌱)、复仇等情节。